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Al momento i principali progetti di ricerca a cui gli studenti possono lavorare durante la tesi magistrale riguardano analisi metagenomiche e metatrascrittomiche delle comunità microbiche presenti in due ambienti marini notevolmente diversi: 1) la laguna di Venezia e 2) l'Oceano Meridionale, in particolare il Mare di Ross.
La tipologia di lavoro prevede sia tecniche di campionamento e di laboratorio che analisi di tipo bioinformatico su dati prodotti da sequenziatori di nuova generazione (principalmente la piattaforma Illumina).